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适用范围:适用于快速从福尔马林固定、石蜡包埋组织样品中提取RNA包括miRNA。
产品储存:本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
储存事项:
1. 所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。
2. 不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。
3. 蛋白酶K保存在即用型甘油缓冲液中,常温运输。收到后,不超过25℃室温至少保存6个月,4℃保存12个月,-20℃保存2年。
4. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
产品介绍:本试剂盒设计用于快速从福尔马林固定、石蜡包埋组织样品中提取RNA包括microRNA。独特的裂解液/蛋白酶K迅速裂解细胞释放出RNA,然后裂解混合物通过一个基因组DNA清除柱,基因组DNA被清除而RNA穿透滤过。滤过的RNA用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的RNase-free Water将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。得到的RNA可用于反转录PCR、荧光定量PCR等实验。
产品特点:
1. 操作安全,完全不使用有毒的苯酚、氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
2. 快速简捷,全程操作只需10步,单个样品RNA提取操作一般可在1小时内完成。
3. 试剂盒的独家基因组清除柱和配方,确保有效清除基因组DNA残留,一般情况下得到的RNA不需要DNase消化,可直接用于反转录PCR、荧光定量PCR等实验。
4. 多次柱漂洗确保RNA高纯度,得到的RNA可直接用于下游各种实验。
注意事项:
1. 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机。
2. 样品处理量绝对不要超过基因组DNA清除柱和RNA吸附柱RA处理能力,否则造成DNA残留或者产量降低。不同组织细胞种类RNA/DNA相差极大,例如胸腺脾脏DNA含量丰富,超过5mg就会超过柱子处理能力。COS细胞RNA含量丰富,超过3x106细胞就会超过柱子吸附能力。所以开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量时宁可使用较少的样品处理量,如不超过2个10μm厚度石蜡切片。实验条件摸索后,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。
3. 裂解液PKD、结合液RBC中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
4. 预防RNase污染及实验前的准备:经常更换新手套,因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。使用RNase-free的塑料制品和枪头避免交叉污染。RNA提取过程中应使用RNase-free的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料器皿可在0.5M NaOH 中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。配制溶液应使用RNase-free的水或DEPC水(DEPC水的制备:将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1%(v/v),37℃放置过夜,高压灭菌)。
5. 关于DNA的微量残留:一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留(DNase消化也无法做到100%无残留),本公司的AipEasy固定包埋组织microRNA快速提取试剂盒,由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组DNA清除柱技术,绝大多数DNA已经被清除,可直接用于反转录PCR和荧光定量PCR。个别特殊情况如DNA含量过于丰富造成残留或者要进行严格的mRNA表达量分析荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:
1) 选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与扩增反应。
2) 选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。
6. RNA纯度及浓度检测:
完整性:RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150v,15分钟)检测完整性。由于石蜡包埋组织福尔马林固定和包埋过程中一般由于RNA与蛋白反应交联会导致RNA断裂或者降解,一般电泳后UV下只能看到模糊弥散(smear)带型,随着储存的时间越长,降解断裂越严重,甚至只能看到峰值仅仅在100bp左右的模糊条带。这都属于RNA提取正常情况。
纯度:OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的参考指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数(10mM Tris,pH7.5)在1.8-2.1之间。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10mM Tris,pH7.5溶液中测出的OD260/OD280读数1.8-2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯。
浓度:取一定量的RNA提取物,用RNase-free水稀释n倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260和OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/μL)=(OD260)×(稀释倍数n)×40。
操作步骤(提取包含microRNA的总RNA):
提示:第一次使用前请先在漂洗液RW瓶中按照标签提示加入指定量无水乙醇!并打钩做好标记避免重复加入!
1. 样本处理
福尔马林固定组织: | 1. 取20-50mg福尔马林固定组织样本,用DEPC水充分清洗干净,要是样本不好裂解,在加入裂解液前需把样本充分剪碎,或用高速微量研磨仪充分研磨粉碎。 2. 接后续操作步骤。 |
石蜡包埋组织: | 1. 修整去除过量包埋组织外石蜡,并切片成10-20μm厚切片。 注:切片厚度必须≥10μm,否则太薄会切碎细胞,造成脱蜡过程中microRNA丢失。 2. 收集总厚度不超过■40μm的石蜡切片到一个1.5-2mL离心管(例如2片20μm、4片10μm的石蜡切片),或者不超过▲80μm的石蜡切片到一个2mL离心管。 注:■代表处理切片总厚度≤40μm,▲代表处理切片总厚度≤80μm。 3. 加入1mL 100%二甲苯,涡旋振荡10秒。瞬间离心把组织全部浸入到二甲苯。 4. 50℃水浴3分钟熔解石蜡,20-25℃最高速离心2分钟,收集组织到管底。 5. 小心用移液器吸弃上清二甲苯,注意不要吸到沉淀。 6. 加入1mL无水乙醇,涡旋振荡,最高速离心2分钟,小心吸弃上清乙醇。 7. 加入1mL无水乙醇,重复步骤6一遍,尽可能吸弃所有乙醇。 8. 室温或37℃晾干乙醇10分钟或直到所有乙醇挥发。 注:乙醇完全晾干非常重要,微量的乙醇残留也会导致RNA产量降低。 9. 接后续操作步骤。 |
2. 吹打或者涡旋振荡充分重悬组织沉淀在■140μL ▲230μL裂解液PKD中,短暂离心收集液体到管底,加20μL蛋白酶K,吹打混匀。
3. 55℃孵育15分钟,然后80℃孵育15分钟。
注:55℃孵育后,可以将离心管取出放置在室温,等水浴锅温度升到80℃后再放入水浴锅,精确的孵育15分钟。即使2分钟的延长也可能导致RNA的部分降解。
4. 加入■320μL ▲500μL结合液RBC,充分吹打混匀调节结合条件。
5. 立刻将混合物加入一个基因组DNA清除柱中,(清除柱放入收集管中)14,000rpm离心30秒,保留滤过液(RNAmicroRNA在滤过液中)。
注:应避免吸到可能有的较大的未消化完全的絮团物质上柱子,以免堵塞离心柱。
6. 加入■1120μL ▲1750μL无水乙醇到滤过液中,立即吹打混匀,不要离心。
注:如果加1750μL无水乙醇,应先将滤过液转到容量超过3mL的离心管后再加入。
7. 立刻将混合物(每次小于700μL,多可以分多次加入)加入一个RNA吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm离心30秒,弃掉废液。
8. 加入500μL漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μL漂洗液RW,重复操作一遍。
9. 将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
10. 取出吸附柱RA,放入一个RNase-free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30μL RNase-free Water(事先在70-90℃水浴中加热可提高产量),室温放置1分钟,12,000rpm 离心1分钟,RNA被洗脱下来收集在离心管中,-70℃保存RNA,防止降解。
注:如果预期RNA产量>30μg,加30-50μL RNase-free Water重复步骤10操作,合并两次洗脱液;如果需要RNA浓度高,可使用第一次的洗脱液重新加回到吸附柱重复步骤操作10。洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量高,比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据实验需要自行选择。
品牌: | 爱普科学 |
英文名称: | AipEasy FFPE Tissue miRNA Rapid Extraction Kit(Centrifugal Column) |
规格: | 50T |
性状: | 液体 |
储存温度: | RT |
保质期: | 12个月 |
产品说明: | 收到产品后,请尽快按照试剂盒内各组分的储存温度保存! |
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